Другие программы: обучение го и чс

мне все понятно  –   Хочу коммерческое предложение

ИТМ ГО и ЧС

ИТМ ГО и ЧС (Инженерно-технические мероприятия гражданской обороны. Мероприятия по предупреждению чрезвычайных ситуаций)

Раздел проектной документации ИТМ ГОЧС — это документ, который содержит перечень мероприятий, которые направлены на предупреждение чрезвычайных ситуаций (ЧС) и уменьшение риска их возникновения, обеспечение защиты населения и территорий от ЧС, снижение материального ущерба от воздействий ЧС техногенного и природного характера, а также от опасностей, возникающих при ведении военных действий, диверсий или террористических актов на рассматриваемой территории или Объекте.

Объем и содержание инженерно-технических мероприятий гражданской обороны (ГО) определяются в зависимости от группы городов по ГО и категорий объектов экономики по ГО с учетом зонирования территории по возможному воздействию современных средств поражения и их вторичных поражающих факторов, а также от характера и масштабов возможных аварий, катастроф и стихийных бедствий.

Объем и содержание инженерно-технических мероприятий по предупреждению чрезвычайных ситуаций (ЧС) природного и техногенного характера зависит от степени потенциальной опасности объекта строительства и рядом расположенных объектов, результатов инженерных изысканий, оценки природных условий и окружающей среды.

В соответствии с требованиями СП 11-107-98 раздел ИТМ ГОЧС необходим в случаях:

• наличии категории по гражданской обороне проектируемого объекта

• наличии группы города по ГО (особой важности, первая, вторая, третья), в котором располагается объект строительства (для объектов на территории категорированных городов)

• наличии категории и группы по ГО расположенных вблизи объектов и городов (если такие имеются)

• требований строительства защитного сооружения ГО (ЗС ГО)

• наличии возможных источников ЧС техногенного характера на проектируемом объекте

• наличии возможных источников ЧС природного и техногенного характера в районе строительства объекта

• требовании по созданию систем оповещения, в том числе локальных систем оповещения

• требовании по мерам предотвращения постороннего вмешательства в деятельность потенциально опасного объекта

• технических условиях для разработки раздела ИТМ ГО и мероприятий по предупреждению ЧС

• дополнительных требованиях по обеспечению безопасности, которые должны быть учтены для разработки ИТМ ГОЧС

Специальный раздел ИТМ ГОЧС в составе проекта строительства подлежат обязательной государственной экспертизе в области защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций в экспертных органах МЧС России.

На экспертизу раздела ИТМ ГОЧС представляется полностью укомплектованная проектная документация в следующем составе:

• задание на проектирование, согласованное с органом управления по делам ГО и ЧС, содержащее требования на разработку ИТМ ГОЧС

• общая пояснительная записка проекта строительства

• разработанный раздел ИТМ ГО ЧС

При необходимости представляются и другие разделы проекта, связанные с вопросами обеспечения безопасности проектируемого объекта, защиты населения и территорий.

Содержание и объем раздела ИТМ ГОЧС может варьировать в зависимости от категории объекта и типа города, от категории опасности объекта, окружающих коммуникаций, характера и масштаба возможной катастрофы, аварии, стихийного бедствия, от местных природных условий, и ряда других нюансов. Раздел ИТМ ГО и ЧС состоит из графических и текстовых материалов.

В этих материалах содержатся как исходные данные, так и требования для разработчиков. В них же находится и информация об объекте и соседних территориях, об участке строительства, с точки рассмотрения безопасности размещения там жителей, экономической и оборонной значимости этих мест. Описание всех технических решений и их обоснование систематизируется, а степень проработки этого раздела должна быть достаточной для возможности проверки. 

Графика раздела – это генеральные и ситуационные планы, профили и разрезы, схемы зон вероятной опасности, охранные и санитарно-защитные зоны, маршруты вывода сил или эвакуации, и др. Масштабы могут подбираться ситуационно, но при этом необходимо соблюдать существующие правила отображения графической информации для ее полноты и наглядности.

Проектирование защитных сооружений различного типа

Защитные сооружения гражданской обороны (ЗСГО) предназначены для защиты населения, личного состава органов управления, узлов связи гражданской обороны (ГО), материального имущества и техники от воздействия современных средств поражения (ССП) противника, а также в случае аварийной ситуации на объекте в результате чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера.
Защитные сооружения ГО относятся к средствам коллективной защиты и разделяются на убежища, противорадиационные укрытия (ПРУ) и простейшие укрытия.
Создание ЗСГО осуществляется в соответствии с Постановлением Правительства РФ от 29 ноября 1999 г. N 1309 «О порядке создания убежищ и иных объектов гражданской обороны».
Защитные сооружения ГО должны приводится в готовность к приему укрываемых в сроки, не превышающие 12 часов, а на атомных станция и химически опасных объектах они должны содержаться в готовности к немедленному приему укрываемых.
Проектирование защитных сооружений выполняется в соответствии со сводом правил СП 88.13330.2014 «Защитные сооружения гражданской обороны» (Актуализированная редакция СНиП II-11-77*), а также с учетом сводов правил, СНиП и ГОСТ обеспечивающих выполнение требований Федерального закона от 30.12.2009 N 384-ФЗ «Технический регламент о безопасности зданий и сооружений».
Укрытию в убежищах подлежит наибольшая работающая смена (НРС) предприятий, расположенная в зоне возможного сильного разрушения.
В мирное время объекты гражданской обороны могут использоваться в интересах экономики и обслуживания населения (склады, обучающие классы и т.д.), с сохранением возможности приведения их в заданные сроки в состояние готовности к использованию по назначению.
По типу ЗСГО подразделяются на отдельно стоящие и встроенные сооружения.
В качестве комплексного освоения подземного пространства, в интересах создания защитных сооружений гражданской обороны могут активно использоваться объекты подземного городского хозяйства (тоннели, склады, коммуникации и т.д.), в том числе многоуровневые подземные стоянки для легковых автомобилей.
Наша компания проектирует защитные сооружения различного типа, класса защиты, с любыми режимами по воздухообмену, включая все необходимые спецрасчёты.

Нормативные документы:

Стоимость работ определяется следующими факторами:

• технологической сложностью объекта
• объемно-планировочными и конструктивными особенностями объекта
• наличием и количеством людей на объекте

Время выполнения работы, при предоставлении запрашиваемой информации в полном объеме и в установленные сроки – от 14 дней

Структура и органы управления ГО и ЧС — Безопасность — ЖИТЕЛЯМ —

Руководящий состав гражданской обороны городского округа Староуткинск

Руководитель гражданской обороны – Глава городского округа Староуткинск Кузовков Сергей Яковлевич, Председатель эвакуационной комиссии – Заместитель главы по ЖКХ транспорту и строительству городского округа Староуткинск Полозникова Лариса Георгиевна, Председатель комиссии по предупреждению и ликвидации чрезвычайных ситуаций и обеспечению пожарной безопасности – Глава городского округа Староуткинск Кузовков Сергей Яковлевич.

Орган, специально уполномоченный на решение задач в области предупреждения и ликвидации ЧС

В соответствии с постановлением Администрации городского округа Староуткинск, работником, уполномоченным на решение задач в области гражданской обороны и защиты населения и территорий городского округа Староуткинск от чрезвычайных ситуаций является специалист первой категории по ГО и ЧС Волков Игорь Владимирович.

Единая дежурно-диспетчерская служба городского округа Староуткинск

Единая дежурно-диспетчерская служба городского округа Староуткинск (ЕДДС ГО Староуткинск) является структурным подразделением муниципального казенного учреждения «Центр хозяйственного обеспечения» (МКУ «ЦХО»). Адрес: р.п. Староуткинск, ул. Советская, 1а. Телефоны: 55-112 (факс), 112. Режим работы: КРУГЛОСУТОЧНО. Начальник ЕДДС: Мазгалин Михаил Владимирович. Эл.почта: [email protected]. Прием граждан по личным вопросам:

10 пожарно-спасательный отряд федеральной противопожарной службы Государственной противопожарной службы Главного управления МЧС Росии по Свердловской области

 (10 ПСО ФПС ГПС Главного управления МЧС Росси по Свердловской области»). Адрес: 623102, г. Первоуральск, ул. Строителей, 13. Тел/факс (3439) 24-04-90, 24-03-70. Эл. почта: [email protected]. Начальник 10 ПСО ФПС ГПС Главного управления МЧС Росии по Свердловской области – подполковник внутренней службы – Атамурадов Руслан Садулаевич. График приёма руководством отряда граждан по личным вопросам: первый вторник 

Отдел надзорной деятельности и профилактической работы ГО Первоуральск

Отдел надзорной деятельности и профилактической работы ГО Первоуральск, Шалинского ГО, ГО Староуткинск УНД и ПР ГУ МЧС России по Свердловской области. 623102 г. Первоуральск, ул. Строителей, 13 тел/факс 8(3439) 24-02-30 эл. почта: [email protected] Начальник отдела подполковник внутренней службы Марьясов Егор Валерьевич. Прием граждан по личным вопросам: Еженедельно по средам с 15:00-17:00

Телефоны экстренных служб

Единый номер вызова экстренных оперативных служб – 112 Номера экстренных оперативных служб: городские сотовые Пожарно-спасательная служба 01 101 Полиция 02 102 Скорая помощь 03 103 Аварийная газовая служба 04 104 Телефон доверия Главного управления МЧС России по Свердловской области – 8 (343) 262-99-99  

Специалист 1 категории ГО и ЧС, мобилизационной работы Администрации ГО Староуткинск

Волков Игорь Владимирович 

Адрес: Свердловская область,п.г.т.Староуткинск , ул.Советская 1-а

тел.: 8(34358)55-5-75

ГО и ЧС – курсы обучения для сотрудников и руководителей

Повышение квалификации

Инженерно-технические мероприятия по гражданской обороне, предупреждению чрезвычайных ситуаций природного и техногенного характера, в том числе на особо опасных, технически сложных и уникальных объектах капитального строительства

144 ч.

Обучение должностных лиц и специалистов организаций и учреждений, отнесенных к категориям по ГО

72 ч.

Обучение по ГО и ЧС специалистов организаций, не отнесенных к категории ГО (работник организаций, не отнесённой к категории ГО, исполняющий обязанности ГО и ЧС по совместительству)

72 ч.

Обучение по ГО и ЧС специалистов организаций, не отнесенных к категории ГО (руководитель организации, не отнесённой к категории ГО)

72 ч.

Ответственный за обеспечение радиационной безопасности и радиационный контроль на предприятии с правом работы с источниками ионизирующего излучения

72 ч.

Обучение командного состава нештатных аварийно-спасательных формирований организаций, учреждений, предприятий

72 ч.

Обучение председателей комиссий по предупреждению и ликвидации чрезвычайных ситуаций и обеспечению пожарной безопасности учреждений

72 ч.

Обучение членов комиссий по предупреждению и ликвидации чрезвычайных ситуаций и обеспечению пожарной безопасности муниципальных образований и организаций (предприятий, учреждений)

140 ч.

Повышение квалификации должностных лиц и специалистов ГО, РСЧС, организаций с круглогодичным пребыванием населения

72 ч.

Повышение квалификации начальников и нештатных консультантов учебно-консультационных пунктов по гражданской обороне и чрезвычайным ситуациям при жилищно-эксплуатационных организациях муниципальных образований

72 ч.

Повышение квалификации преподавателей-организаторов курса ОБЖ

72 ч.

Повышение квалификации работников гражданской обороны и единой государственной системы предупреждения и ликвидации чрезвычайных ситуаций (по совместительству)

72 ч.

Повышение квалификации работников организаций, осуществляющих радиационный (дозиметрический) и химический контроль на производстве и в сфере обслуживания

72 ч.

Повышение квалификации руководителей (заместителей) спасательных служб муниципальных образований, организаций

72 ч.

Повышение квалификации руководителей групп занятий по гражданской обороне и защите от чрезвычайных ситуаций организаций, учреждений, предприятий

72 ч.

Повышение квалификации руководителей и работников службы «112»

72 ч.

Повышение квалификации руководителей и специалистов единых дежурно-диспетчерских служб муниципальных образований и дежурно-диспетчерских служб организаций

72 ч.

Повышение квалификации руководителей и специалистов организаций по основам радиационной безопасности, защите от источников ионизирующих излучений и мерам безопасности при обнаружении взрывоопасных предметов

72 ч.

Повышение квалификации руководителей органов управления, уполномоченных на решение задач в области защиты населения и территорий от чрезвычайных ситуаций и гражданской обороны муниципальных образований и организаций

72 ч.

Программа подготовки руководителей и специалистов потенциально-опасных объектов и объектов жизнеобеспечения в области защиты от чрезвычайных ситуаций

72 ч.

Руководители (работники) структурных подразделений организаций, уполномоченные на решение задач в области защиты населения и территорий от ЧС и ГО

72 ч.

Анализ обогащения GO

Одним из основных применений GO является выполнение анализа обогащения наборов генов. Например, учитывая набор генов, которые активируются при определенных условиях, анализ обогащения обнаружит, какие термины GO чрезмерно представлены (или недостаточно представлены) с использованием аннотаций для этого набора генов.

Пользователи могут выполнять анализ обогащения прямо с домашней страницы веб-сайта GOC. Эта служба подключается к инструменту анализа из системы классификации PANTHER, которая постоянно обновляется с помощью аннотаций GO.Система классификации PANTHER подробно объясняется в Mi H et al, PMID: 23868073. Список поддерживаемых идентификаторов генов доступен на веб-сайте PANTHER.

Использование инструментов анализа обогащения GO

1. Вставьте или введите названия генов для анализа, по одному в каждой строке или через запятую. Инструмент может обрабатывать как имена генов, специфичные для MOD, так и идентификаторы UniProt (например, Rad54 или P38086).

2. Выберите аспект GO (молекулярная функция, биологический процесс, клеточный компонент) для анализа. (биологический процесс по умолчанию).

3. Выберите вид, от которого происходят ваши гены. (по умолчанию – Homo sapiens).

4. Нажмите кнопку подтверждения. Обратите внимание, что вы сможете загрузить СПИСОК СПИСОК (он же «фоновый») на более позднем этапе.

5. Вы будете перенаправлены к результатам на сайте PANTHER. Эти результаты основаны на обогащении относительно набора всех генов, кодирующих белок в геноме, выбранном на шаге 3.

6. (необязательно, но НАСТОЯТЕЛЬНО РЕКОМЕНДУЕТСЯ) Добавьте настраиваемый СПИСОК СПРАВОЧНИКОВ и повторно запустите анализ. Нажмите кнопку «изменить» в строке «Контрольный список» сводки анализа PANTHER в верхней части страницы результатов, загрузите файл контрольного списка и нажмите кнопку «Запустить анализ» , чтобы повторно запустить анализ анализ. Справочный список должен быть списком всех генов, из которых был выбран ваш меньший список анализа. Например, в списке дифференциально экспрессируемых генов список ссылок должен содержать только те гены, которые вообще были обнаружены в эксперименте и, таким образом, потенциально могли быть в списке генов, полученных в результате эксперимента.

Интерпретация результатов таблицы

На странице результатов отображается таблица, в которой перечислены важных общих терминов GO (или родительских терминов GO) , используемых для описания набора генов, введенных пользователями на предыдущей странице, фоновая частота , частота выборки , ожидаемое значение p , указание на избыточное / недопредставление для каждого члена и значение p . Кроме того, на странице результатов отображаются все критерии, использованные в анализе.Любые неразрешенные имена генов будут перечислены в верхней части таблицы.

Частота фона и частота дискретизации

Частота фона – это количество генов, аннотированных к члену GO во всем фоновом наборе, а частота выборки – это количество генов, аннотированных к этому члену GO во входном списке. Например, если входной список содержит 10 генов и обогащение выполняется для биологического процесса в S. cerevisiae, чей фоновый набор содержит 6442 гена, то если 5 из 10 входных генов аннотированы термином GO: восстановление ДНК, тогда частота выборки для репарации ДНК будет 5/10.Если во всем геноме S. cerevisiae есть 100 генов, аннотированных для репарации ДНК, то фоновая частота будет 100/6442.

Перепредставлен или недостаточно представлен

Символы «+» и «-» указывают на то, что термин не представлен в полной или меньшей степени.

P-значение

Значение P – это вероятность или шанс увидеть по крайней мере x количество генов из общего числа n генов в списке, аннотированных для конкретного термина GO, с учетом доли генов во всем геноме, которые аннотированы для этого GO. Срок.То есть термины GO, общие для генов в списке пользователя, сравниваются с фоновым распределением аннотации. Чем ближе значение p к нулю, тем значительнее конкретный член GO, связанный с группой генов (т.е. тем менее вероятно, что наблюдаемая аннотация конкретного члена GO к группе генов происходит случайно).

Другими словами, при поиске в онтологии процесса, если бы все гены в группе были связаны с «репарацией ДНК», этот термин был бы значимым.Однако, поскольку все гены в геноме (с аннотациями GO) косвенно связаны с термином верхнего уровня «биологический_процесс», это не имело бы значения, если бы все гены в группе были связаны с этим термином очень высокого уровня.

Существует ряд различных инструментов, которые предоставляют возможности обогащения. Некоторые из них основаны на Интернете, в то время как другие могут потребовать от пользователя загрузки приложения или установки локальной среды. Инструменты различаются используемыми алгоритмами, выполняемыми статистическими тестами и частотой обновления базовых данных GO.Поэтому пользователи должны проявлять осторожность при использовании внешних инструментов, особенно если версию GO невозможно сразу идентифицировать.

Некоторые одобренные GO инструменты обогащения:

Введение в аннотации GO

Аннотация GO – это заявление о функции определенного гена. Аннотации GO создаются путем связывания гена или генного продукта с термином GO. Вместе эти утверждения составляют «снимок» современных биологических знаний. Следовательно, аннотации GO фиксируют утверждения о том, как ген функционирует на молекулярном уровне, где в клетке он функционирует и какие биологические процессы (пути, программы) он помогает выполнять.

Есть четыре элемента информации, которые однозначно идентифицируют аннотацию GO. Хотя есть дополнительные компоненты, которые куратор может использовать для указания дополнительной информации, включая квалификаторы и расширения аннотаций, аннотация состоит как минимум из:

• Генный продукт (может быть белком, РНК и т. Д.)
• GO срок
• Номер ссылки
• Доказательства

Различные знания о функции генов могут быть установлены в разной степени, поэтому каждая аннотация GO всегда ссылается на доказательства, на которых она основана.Все аннотации GO прямо или косвенно поддерживаются научной литературой. В GO подтверждающие доказательства представлены в форме кодов доказательств GO и либо опубликованной справочной информации, либо описания методологии, использованной для создания аннотации. Коды доказательств GO описывают тип доказательства и отражают, насколько далеко аннотированное утверждение от прямых экспериментальных доказательств, а также проверялось ли это доказательство экспертом-биокуратором.

Семантика аннотации GO

Связь продуктов генов с терминами GO – это утверждения, описывающие

• Молекулярная функция: молекулярная активность отдельных генных продуктов
• Клеточный компонент: где активны генные продукты
• Биологический процесс: пути и более крупные процессы, в которых активность генного продукта способствует

Общие принципы аннотаций GO

• Аннотации представляют нормальные функции генных продуктов.
• Продукт гена может быть аннотирован нулем или более терминами из каждой онтологии.
• Каждая аннотация поддерживается GO Evidence Codes из онтологии Evidence and Conclusions и ссылкой.
Продукты генов
• аннотированы самым детальным термином в онтологии, что подтверждается имеющимися доказательствами.
• Согласно принципу транзитивности, аннотация к члену GO подразумевает аннотацию ко всем его родительским элементам.
Аннотации
• GO предназначены для отражения самого современного взгляда на роль генного продукта в биологии.
• Поскольку биологические знания изменяются, аннотации для данного генного продукта могут изменяться, чтобы отражать изменения в знаниях и / или изменения в онтологии.
• Существует предположение об открытом мире, то есть, если продукт гена не аннотирован, его роль все еще неизвестна.

Квалификаторы аннотации

Некоторые аннотации изменяются квалификаторами, которые имеют определенные правила использования и значения в GO. В формате GAF используются НЕ , способствует_ и колокализирует_ с квалификаторами .

Квалификатор

НЕ используется для явного указания на то, что экспериментально продемонстрировано, что продукт гена не способен выполнять конкретную деятельность или что он потерял функцию (например, потеря активного сайта или быстрая дивергенция после события дублирования) в ходе эволюции. Это особенно важно в тех случаях, когда следует избегать связывания термина GO с генным продуктом (но это может быть сделано в противном случае, особенно с помощью автоматизированного метода).Например, если белок имеет сходную последовательность с ферментом (активность которого GO: nnnnnnn), но экспериментально показано, что , а не , обладает ферментативной активностью, он обозначается как НЕ GO: nnnnnnn. НЕ также используется, когда в цитируемой ссылке прямо говорится (например, «наш любимый белок не находится в ядре»). Квалификация аннотации с квалификатором НЕ позволяет аннотаторам утверждать, что конкретный генный продукт , а не , связан с конкретным термином GO.Он используется, когда в противном случае можно было бы ожидать, что термин GO применим к продукту гена, но эксперимент, анализ последовательности и т. Д. Доказывают обратное. (Обычно он не используется для отрицательных или неубедительных экспериментальных результатов.)

Contributes_to появляется в аннотации GO, когда функция белкового комплекса облегчается, но не выполняется непосредственно одной из его субъединиц. Аннотирование продуктов отдельных генов в соответствии с атрибутами комплекса особенно полезно для аннотаций молекулярных функций в тех случаях, когда комплекс имеет активность, но не все отдельные субъединицы.(Например, может существовать известная каталитическая субъединица и одна или несколько дополнительных субъединиц, или активность может присутствовать только тогда, когда комплекс собран.) Аннотации молекулярных функций отдельных субъединиц, работающих как комплексы, в которых ни одна отдельная субъединица не обладает активностью, должны включить в аннотацию sizes_to . Квалификатор sizes_to не следует использовать в аннотациях биологических процессов. Все генные продукты, аннотированные с использованием sizes_to , также должны быть аннотированы термином клеточного компонента, представляющим комплекс, обладающий активностью.Обратите внимание, что вносит вклад в не требуется для аннотирования каталитической субъединицы. Кроме того, способствует может использоваться для любой некаталитической субъединицы, независимо от того, является ли субъединица существенной для активности комплекса или нет.

Colocalizes_with появляется в аннотации GO, чтобы указать временную или периферическую ассоциацию белка с органеллой или комплексом. Этот квалификатор также может использоваться в случаях, когда разрешение анализа недостаточно точное, чтобы сказать, что генный продукт является добросовестным компонентом.Например, деполимераза микротрубочек человека KIF2A динамически локализуется на полюсах веретена, регулируя деградацию микротрубочек во время митотической прогрессии. Поэтому KIF2A аннотируется GO: 0000922: полюс шпинделя с использованием квалификатора colocalizes_with на основе PMID: 18411309.

Расширения аннотаций

Расширения аннотаций предоставляют дополнительную информацию об аннотации GO, которая не может быть записана в одном термине GO. См. Публикации, описывающие расширения аннотаций: Huntley & Lovering 2017 и Huntley et al. 2014. Расширения аннотаций доступны как в формате файла GAF, так и в формате файла GPAD.

Контроль качества аннотаций

Консорциум GO реализует ряд автоматизированных запросов для проверки качества аннотаций, отправленных в базу данных GO.

Модели причинно-следственной деятельности GO

GO-Causal Activity Model (GO-CAM) использует определенную «грамматику» для связывания нескольких стандартных аннотаций GO с более крупными моделями биологической функции (такими как «пути») семантически структурированным образом.Как минимум, модель GO-CAM должна соединять как минимум две стандартные аннотации GO (пример GO-CAM).

Первичной единицей биологического моделирования в GO-CAM является молекулярная активность, например протеинкиназная активность конкретного генного продукта или комплекса. Молекулярная активность – это активность, осуществляемая на молекулярном уровне генным продуктом; это определяется термином из онтологии GO MF. Таким образом, модели GO-CAM представляют собой соединения аннотаций GO MF, обогащенные за счет предоставления соответствующего контекста, в котором происходит эта функция.Все соединения в модели GO-CAM, например Между продуктом гена и действием два действия или действие и дополнительная контекстная информация создаются с использованием четко определенных семантических отношений из онтологии отношений.

GO-CAM можно просматривать и визуализировать на http://geneontology.org/go-cam

Типы файлов аннотаций GO

Загрузки

GO как динамический источник биологических аннотаций

GO стремится представить текущее состояние знаний в области биологии, поэтому он постоянно пересматривается и расширяется по мере накопления биологических знаний.

В связи с постоянно растущим числом публикуемых статей, экспериментов и методов всегда сложно охватить всю биологию самыми последними аннотациями. Поэтому мы приглашаем исследователей и ученых-вычислителей отправлять запросы на отсутствие, ошибочные или устаревшие аннотации для улучшения базы данных GO.

Статистика

GO доступна как для текущего выпуска, так и по времени.

GO Архив

Обширный архив онтологии и аннотаций GO с 2004 года.Обратите внимание, что это заменяет прежний GO CVS, SVN и старый архив.

[Быстрый доступ к архиву GO]

Иерархия папок выпуска GO

• аннотации: содержит аннотации GO в виде файлов GAF. Файлы GPAD и GPI доступны с марта 2018 г. с новыми выпусками GO DOI
.
• annotations / gp2protein (до февраля 2018 г.): содержит файлы, сопоставляющие генные продукты (обычно идентификаторы MOD) с белками (инвентарный номер UniProtKB)
• annotations / gp2rna (до февраля 2018 г.): эквивалент файлов gp2protein, но для некодирующих РНК (сопоставление с центральными идентификаторами РНК)
Онтология
• : содержит онтологию GO (файлы obo и owl) – пользователям рекомендуется использовать ontology / go.obo (формат obo 1.2), если им не нужно возвращаться дальше марта 2009 г., и ontology / gene_ontology.obo (формат obo 1.0), если им нужно вернуться в начало архива
Онтология / расширения
• (с мая 2015 г.): содержит различные онтологии, импортированные или произведенные GO
.
• онтология / external2go: файлы, отображающие GO на различные ресурсы (например, interpro, kegg, reactome и т. Д.)
Онтология / подмножества
• (с октября 2004 г.): содержит тонкие компоненты GO, используемые для упрощения онтологии для определенных целей (например,грамм. goslim_synapse) или организмов (например, goslim_pombe) – мы рекомендуем использовать файлы .obo (с 2004 г. по настоящее время), а не старые устаревшие файлы .go (2004-2009 гг.)
• mysql_dumps (до января 2017 г.): содержит дампы MySQL GO (например, -assocdb, -termdb)
• продуктов / аннотаций: содержит аннотации GO, предоставленные MOD консорциуму GO. Эти файлы хранятся для прозрачности, но пользователям рекомендуется использовать аннотации GO в аннотациях /, поскольку они могут отличаться из-за различной фильтрации и проверок, выполняемых консорциумом GO для обеспечения качества

Дополнительное примечание по подмножествам GO

Подмножества GO с 2004 по 2018 были депонированы, чтобы обеспечить легкий доступ к GO slim, используемому в конкретной публикации или анализу, и для повторного использования сообществом GO в то время.Некоторые из этих тонких дисков GO больше не поддерживаются авторами и, как таковые, могут содержать устаревшие термины GO. Хотя мы рекомендуем использовать файлы .obo (в соответствии с нашими текущими выпусками), старые и устаревшие файлы .go хранились в архиве. В файлах .go происхождение и родство указываются символами отступа и пунктуации (например, «%» для обозначения отношения is_a).

Если вам нужны современные, активно обслуживаемые модели GO Slim, см. Руководство по подмножествам GO

Выпуски GO DOI (март 2018+)

В дополнение к иерархии папок, описанной выше, выпуски GO DOI, выпущенные с марта 2018 года, содержат дополнительные папки.Эти папки полезны только нескольким людям, которые хотели бы или должны были воспроизвести выпуск GO, используя, например, набор программ (bin /) и библиотек (lib /), доступных на момент выпуска. Начиная с октября 2019 года GO также предоставляет различные файлы статистики в release_stats /.

Как создавался Архив ГО

Архив был создан с использованием данных, разбросанных по трем унаследованным системам, а именно GO CVS, GO SVN и архиву старого продукта. Каждая из этих систем создавалась в разное время для различных целей, и они были частично избыточными, как с точки зрения типов данных, которые они содержали, так и с точки зрения временных рамок (например,грамм. SVN поддерживалась с 2011 по 2018 год, а CVS поддерживалась с 2002 по 2018). Проект размещен на GitHub.

Пожалуйста, обращайтесь в службу поддержки GO, если у вас есть какие-либо вопросы.

Категории онтологии гена

Прежде чем ответить на ваш конкретный вопрос, я хотел бы сделать краткий обзор анализа обогащения на основе генной онтологии:

Для выполнения анализа биологического обогащения с использованием онтологий необходимы следующие данные:

1. Список генов, нарушенных в эксперименте (скажем, микрочип, next-gen секвенирование, протеомика и т. д.)
2. Фоновый список генов для вашего исследования (это может быть список генов что вы использовали для получения возмущенные гены из микрочипа, ngs, протеомика и др.Например, список гены в микрочипе, гены в данный геном и т. д.)
3. Онтология (в данном случае ген_онтология)
4. Файл ассоциации онтологий генов (в этом файле вы можете найти термины GO, назначенные генам в списках, упомянутых в пунктах 1 и 2)

Примечание: существует несколько четко определенных биологических онтологий, но вы можете не найти соответствующих данных ассоциации. Доступный список данных ассоциации GO см. GOA

Анализ обогащения:

Расчеты обогащения классифицируются по 3 категориям Huang et.al as singular enrichment analysis (SEA) , gene set enrichment analysis (GSEA) and modular enrichment analysis (MEA) . Основное различие между этими тремя классами алгоритмов обогащения заключается в способе вычисления p-значений обогащения.

В подходе, основанном на SEA, аннотации подмножества генов оцениваются по очереди по списку фоновых генов. P-значение обогащения рассчитывается путем сравнения наблюдаемой частоты аннотационного члена с частотой, ожидаемой случайно и отдельными терминами за пределами отсечения p-значения (P-значение ≤ 0.05). FunctAssociate и Onto-express – два инструмента анализа обогащения на основе SEA.

GSEA аналогичны, но при анализе обогащения учитывают все гены, а не гены на основе заранее определенного порога, как в подходе SEA. GSEA from broad – это пример инструмента на основе GSEA.

MEA, такие как Ontologizer 2.0 и topGO, используют отношения, существующие между аннотациями. Сообщалось, что эти программы достигли большей чувствительности и специфичности из-за рассмотрения взаимосвязей GO-терминов.

Эти инструменты основаны на аналогичных статистических / алгоритмических концепциях. См. Обзор 68 инструментов, опубликованный в 2008 г., здесь. Вы можете увидеть различия на уровне от незначительного до среднего в способе обработки узлов, вычислении статистики и т. Д. Статистические методы для получения значения P включают точный тест Фишера, гипергеометрический функция, биномиальный тест, критерий χ2 или комбинация этих методов.

Для выполнения такого анализа можно использовать один из инструментов командной строки пакета R / серверов /.См. Список инструментов на основе GO, составленный командой AmiGO здесь.

Теперь к вашему конкретному вопросу: Q: каковы критерии для ранжирования этих категорий? Они основаны на p-значениях?

А: Да. Они основаны на P-value . Видеть раздел по SEA, GSEA и MEA для различные методы для получения Значение P .

Подробный обзор концепций, обсуждаемых в этом ответе, см. В следующих статьях 1, 2, 3, 4, 5, 6

Получить бизнес-лицензию | dcra

Деловая деятельность в Округе и / или за его пределами требует, чтобы владельцы / операторы имели лицензию в соответствии с проводимой деловой деятельностью (например,грамм. круглосуточные магазины, подрядчики по благоустройству жилья, аренда жилья, рестораны).

Каждая лицензируемая деятельность имеет набор требований, см. Категории ниже, но все лицензии должны соответствовать четырем требованиям, изложенным в Шагах по получению базовой бизнес-лицензии.

Ознакомьтесь с инструкциями по получению базовой бизнес-лицензии

Как подать заявку на лицензию

Интернет
«Пропустите поездку» и используйте My DC Business Center для ведения дел, где и когда захотите.Ниже приведены требования к заявкам для каждой категории, по которой можно подать заявку онлайн. Если у вас есть более подробные вопросы о требованиях и / или категориях, свяжитесь с нами по телефону (202) 442-4400.

Посетите мой бизнес-центр DC

Quick Form
Хотите ли вы создать местную компанию с ограниченной ответственностью (DLLC) и подать заявку на получение General Business License (GBL) через одно приложение? Подайте заявку на получение местной LLC и генеральной лицензии на ведение бизнеса.

Подать заявку сегодня

Лично
Посетите нас по адресу 1100 4 ^th Street, SW, 2 ^nd Floor, Washington, DC 20024, чтобы подать заявку и получить лицензию. В зависимости от типа лицензии ваша лицензия может быть выдана в тот же день.

Получите разрешение на проживание в доме

Это разрешение требуется для ведения бизнеса из дома. (Вы должны проживать в округе Колумбия, и это должно быть ваше основное место жительства)

Подать заявку на разрешение

Примечание. Для каждой категории, кроме последней категории («Регулируемые предприятия»), требования идентичны для всех лицензий в этой категории.Однако график оплаты может варьироваться в зависимости от типа лицензии.

Общие сведения о категориях медицинского страхования на торговой площадке

Планы на торговой площадке представлены в 4 «металлических» категориях: бронзовый, серебряный, золотой и платиновый.(«Катастрофические» планы также доступны некоторым людям.)

FYI Категории металлов основаны на том, как вы и ваш план разделяете расходы на ваше медицинское обслуживание. К качеству ухода они не имеют никакого отношения.

Как вы и ваша страховая программа разделяете расходы

53